Původ jména města kdysi spojoval Václav Krolmus s hejny strak, které se v současné době stávají znovu téměř domácími opeřenci. Název však pochází od Strakoniců nebo Strachoniců, tedy příslušníků lidu praotce Straky, Stracha, Strakoně či Strachoně.

 straka, stračí. Všesl.-p.sroka,r.soróka, s./ch. svrȁka, csl.
církevněslovanský svraka. Psl. *sorka  odpovídá lit.
litevský šárka, stpr.
staropruský sarke tv., dále se srovnává se sti.
staroindický śārikā ‘indická straka’. V č.
český je vložené -t- a rovněž-v-v některých slov.jazycích se považuje za sekundární,i když někteří rekonstruují výchozí *svorka, jemuž prý odpovídá alb.
albánský sorrë ‘vrána’. Východiskem je asi ie.*k̸er-‘černý ,tmavý’(A1), lze však pomýšlet i na palatalizovanou variantu onom. kořene*ker-,který jev lat.corvus ‘havran’,ř. kórax tv.inašem  :krákorat

Takže původ možný od ptáka straky, nebo z některé vlastnosti vzniklo příjmení

 Straka. - podle vlastností  ptáka  - nenechavost, pestrost, hlučnost;  podle domovního znamení; straka - též strakaté dobytče ; sekera u vinařů; z místního jména Straky; lidově Straka  - zejména u rodin s židovskými předky. 

Strach, Strachota, Strachoň - od podstatného jména strach -  jméno přeložil Metoděj a chybně je spojil s latinským metus = strach.

Strakoň,  Strakoš - od strakatý, pestrý. 

D. Moldanová: Naše příjmení